不同类型房屋在南京装修公司的报价差异主要体现在装修面积、设计风格、材料选择以及施工工艺等方面。

一般来说，普通住宅的装修价格相对较低，公寓和别墅的装修价格则较高。此外，复式、跃层和错层等特殊类型的房屋在装修时需要考虑的因素更多，因此报价可能会相对较高。

在设计风格方面，现代简约风格的装修报价相对较低，而欧式、美式、中式等风格的装修报价则较高。不同风格的装修报价差异主要体现在材料选择、施工工艺以及设计费用等方面。

在材料选择方面，不同材料的报价差异较大。例如，使用高档的装修材料，如大理石、实木等，报价会相对较高；而使用普通的装修材料，如瓷砖、乳胶漆等，报价则会相对较低。

在施工工艺方面，不同施工工艺的报价也有所差异。例如，采用复杂的施工工艺，如吊顶、背景墙等，报价会相对较高；而采用简单的施工工艺，如刷墙、铺地板等，报价则会相对较低。

综上所述，不同类型房屋在南京装修公司的报价差异主要体现在装修面积、设计风格、材料选择以及施工工艺等方面。建议在选择装修公司时，要结合自己的需求和预算进行综合考虑。